本署隸屬臺灣高等法院檢察署，主要任務為追訴犯罪及指揮刑事裁判之執行，藉以維護社會治安，保障人民生命、自由、財產之安全。本署置檢察長一人、主任檢察官、檢察官、檢察事務官、檢驗員各若干人，並設書記處、觀護人室、人事室、會計室、統計室、政風室及資訊室等一級單位，書記處之下設紀錄科、執行科、文書科、研究考核科、總務科及法警室。此外，本署檢察長並依法監督法務部矯正署臺東看守所及法務部矯正署臺東少年觀護所。
